You can have any expression on the RHS, and list the parameters to optimize over in start=. The only reason to restrict to SSfpl and friends is that they are SelfStarting, i.e., they contain methods to compute reasonable starting values, but you were giving start= anyway.
- pd > On 11 Jul 2017, at 07:16 , PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz> wrote: > > Hi > > Great. I did not think that such combination is posssible. > > Thanks. > Petr > >> -----Original Message----- >> From: peter dalgaard [mailto:pda...@gmail.com] >> Sent: Tuesday, July 11, 2017 1:11 AM >> To: PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz> >> Cc: r-help@r-project.org >> Subject: Re: [R] fit lognorm to cdf data >> >> How about >> >> proc <- c(0.9, 0.84, 0.5, 0.16, 0.1) >> size <- c(0.144, 0.172, 0.272, 0.481, 0.583) >> plot(size, proc, xlim=c(0,1), ylim=c(0,1)) >> fit<-nls(proc~plnorm(size, log(xmid), sdlog, lower=FALSE), >> start=list(xmid=0.2, >> sdlog=.1)) >> summary(fit) >> lines(fitted(fit)~size) >> >> -pd >> >>> On 10 Jul 2017, at 16:27 , PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz> wrote: >>> >>> Dear all >>> >>> I am struggling to fit data which form something like CDF by lognorm. >>> >>> Here are my data: >>> >>> proc <- c(0.9, 0.84, 0.5, 0.16, 0.1) >>> size <- c(0.144, 0.172, 0.272, 0.481, 0.583) >>> plot(size, proc, xlim=c(0,1), ylim=c(0,1)) >>> fit<-nls(proc~SSfpl(size, 1, 0, xmid, scal), start=list(xmid=0.2, scal=.1)) >>> lines(seq(0,1,.01), predict(fit, newdata=data.frame(sito=seq(0,1,.01))), >>> col=2) >>> >>> I tried to fit with SSfpl, which is let say close but probably not enough. >>> I tried >> to find how to fit lognorm CDF to my data but did not find an easy solution. >>> >>> Before I start to invent wheel I ask for some hints. I thought about using >> optim together with plnorm or to feed nls with lognorm function but maybe >> somebody already solved such task. >>> >>> Best regards >>> Petr >>> >>> ________________________________ >>> Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou >> určeny pouze jeho adresátům. >>> Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně >> jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze >> svého systému. >>> Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email >> jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. >>> Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi >> či zpožděním přenosu e-mailu. >>> >>> V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: >>> - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření >>> smlouvy, a >> to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. >>> - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; >> Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany >> příjemce s >> dodatkem či odchylkou. >>> - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným >> dosažením shody na všech jejích náležitostech. >>> - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za >>> společnost >> žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo >> písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto >> emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich >> existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. >>> >>> This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are >> intended only for its intended recipients. >>> If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its >>> sender. >> Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from >> your >> system. >>> If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not >>> authorized to >> use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. >>> The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused >> by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email. >>> >>> In case that this e-mail forms part of business dealings: >>> - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a >> contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. >>> - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately >> accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance >> of >> the offer on the part of the recipient containing any amendment or variation. >>> - the sender insists on that the respective contract is concluded only upon >>> an >> express mutual agreement on all its aspects. >>> - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter >>> into >> any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she is >> expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power of >> attorney is submitted to the recipient or the person represented by the >> recipient, or the existence of such authorization is known to the recipient >> of the >> person represented by the recipient. >>> ______________________________________________ >>> R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see >>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help >>> PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting- >> guide.html >>> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. >> >> -- >> Peter Dalgaard, Professor, >> Center for Statistics, Copenhagen Business School >> Solbjerg Plads 3, 2000 Frederiksberg, Denmark >> Phone: (+45)38153501 >> Office: A 4.23 >> Email: pd....@cbs.dk Priv: pda...@gmail.com >> >> >> >> >> >> >> >> > > > ________________________________ > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou > určeny pouze jeho adresátům. > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně > jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze > svého systému. > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email > jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či > zpožděním přenosu e-mailu. > > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, > a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; > Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany > příjemce s dodatkem či odchylkou. > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným > dosažením shody na všech jejích náležitostech. > - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost > žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně > pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu > případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je > adresátovi či osobě jím zastoupené známá. > > This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are > intended only for its intended recipients. > If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender. > Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from > your system. > If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized > to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. > The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused > by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email. > > In case that this e-mail forms part of business dealings: > - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a > contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. > - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately > accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance > of the offer on the part of the recipient containing any amendment or > variation. > - the sender insists on that the respective contract is concluded only upon > an express mutual agreement on all its aspects. > - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter > into any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she > is expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power > of attorney is submitted to the recipient or the person represented by the > recipient, or the existence of such authorization is known to the recipient > of the person represented by the recipient. -- Peter Dalgaard, Professor, Center for Statistics, Copenhagen Business School Solbjerg Plads 3, 2000 Frederiksberg, Denmark Phone: (+45)38153501 Office: A 4.23 Email: pd....@cbs.dk Priv: pda...@gmail.com ______________________________________________ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
