Sorry the result is long, the dimensions of the data frama are 4626x21. I
didn't know if I should truncate anything.
dput(head(df2))
structure(list(X1 = c("4626", NA, NA, NA, NA, NA), X2 = c("96",
NA, NA, NA, NA, NA), X3 = c("29", NA, NA, NA, NA, NA), X4 = c("88",
NA, NA, NA, NA, NA), X5 = c("122", NA, NA, NA, NA, NA), X6 = c("68",
NA, NA, NA, NA, NA), X7 = c("108", NA, NA, NA, NA, NA), X8 = c("38",
NA, NA, NA, NA, NA), X9 = c("120", NA, NA, NA, NA, NA), X10 = c("109",
NA, NA, NA, NA, NA), X11 = c("125", NA, NA, NA, NA, NA), X12 = c("47",
NA, NA, NA, NA, NA), X13 = c("81", NA, NA, NA, NA, NA), X14 = c("62",
NA, NA, NA, NA, NA), X15 = c("68", NA, NA, NA, NA, NA), X16 = c("68",
NA, NA, NA, NA, NA), X17 = c("91", NA, NA, NA, NA, NA), X18 = c("84",
NA, NA, NA, NA, NA), X19 = c("101", NA, NA, NA, NA, NA), X20 = c("26",
NA, NA, NA, NA, NA), X21 = c("66", NA, NA, NA, NA, NA)), .Names = c("X1",
"X2", "X3", "X4", "X5", "X6", "X7", "X8", "X9", "X10", "X11",
"X12", "X13", "X14", "X15", "X16", "X17", "X18", "X19", "X20",
"X21"), row.names = c(NA, 6L), class = "data.frame")
dput(head(df1))
"amt:Amet_4799", "amt:Amet_4800", "amt:Amet_4801", "amt:Amet_4802",
"GENE"), class = "factor"), V2 = structure(c(96L, 31L, 19L, 2L,
12L, 76L), .Label = c("0", "1", "10", "102", "104", "107", "11",
"111", "113", "12", "123", "13", "14", "15", "156", "16", "17",
"18", "19", "2", "20", "207", "21", "22", "23", "24", "25", "26",
"27", "28", "29", "3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36",
"37", "38", "39", "4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46",
"47", "48", "49", "5", "50", "51", "52", "53", "54", "55", "56",
"57", "58", "59", "6", "60", "61", "62", "63", "64", "65", "66",
"67", "68", "69", "7", "70", "71", "72", "73", "74", "75", "76",
"77", "79", "8", "80", "81", "82", "86", "9", "90", "91", "95",
"96", "A"), class = "factor"), V3 = structure(c(29L, 1L, 20L,
1L, 1L, 2L), .Label = c("0", "1", "10", "11", "12", "13", "14",
"15", "16", "17", "18", "19", "2", "20", "21", "22", "24", "25",
"26", "3", "33", "34", "4", "5", "6", "7", "8", "9", "C"), class = "factor"),
V4 = structure(c(88L, 24L, 13L, 42L, 18L, 20L), .Label = c("0",
"1", "10", "105", "11", "110", "112", "12", "13", "131",
"14", "143", "15", "152", "16", "17", "179", "18", "19",
"2", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28",
"29", "3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37",
"38", "39", "4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46",
"47", "48", "49", "5", "50", "52", "53", "54", "55", "56",
"57", "58", "59", "6", "60", "61", "62", "63", "64", "65",
"66", "67", "68", "69", "7", "70", "72", "74", "75", "77",
"78", "79", "8", "82", "9", "91", "97", "99", "D"), class = "factor"),
V5 = structure(c(122L, 54L, 63L, 82L, 48L, 113L), .Label = c("0",
"1", "10", "100", "101", "104", "105", "107", "109", "11",
"110", "111", "112", "114", "115", "116", "119", "12", "122",
"124", "125", "127", "128", "13", "130", "131", "14", "144",
"15", "16", "17", "170", "18", "180", "19", "2", "20", "21",
"215", "22", "23", "232", "24", "25", "26", "27", "28", "29",
"3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38",
"39", "4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47",
"48", "49", "5", "50", "51", "52", "53", "54", "55", "56",
"57", "58", "59", "6", "60", "61", "62", "63", "64", "65",
"66", "67", "68", "69", "7", "70", "71", "72", "73", "74",
"75", "76", "77", "78", "79", "8", "80", "81", "82", "84",
"85", "86", "87", "89", "9", "90", "91", "92", "93", "94",
"95", "96", "99", "E"), class = "factor"), V6 = structure(c(68L,
11L, 6L, 2L, 3L, 47L), .Label = c("0", "1", "10", "108",
"11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "2",
"20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29",
"3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38",
"39", "4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47",
"48", "49", "5", "50", "51", "52", "53", "54", "55", "56",
"57", "58", "59", "6", "60", "63", "65", "7", "8", "88",
"89", "9", "92", "F"), class = "factor"), V7 = structure(c(108L,
16L, 18L, 100L, 26L, 47L), .Label = c("0", "1", "10", "100",
"107", "11", "116", "119", "12", "129", "13", "130", "135",
"14", "15", "16", "17", "18", "187", "19", "199", "2", "20",
"208", "21", "22", "222", "23", "230", "24", "25", "26",
"27", "28", "29", "3", "30", "31", "32", "33", "34", "35",
"36", "37", "38", "39", "4", "40", "41", "42", "43", "44",
"45", "46", "47", "48", "49", "5", "50", "51", "52", "53",
"54", "55", "56", "57", "58", "59", "6", "60", "61", "62",
"63", "64", "65", "66", "67", "68", "69", "7", "70", "71",
"72", "73", "74", "75", "76", "77", "78", "79", "8", "80",
"81", "82", "84", "85", "87", "88", "89", "9", "90", "91",
"93", "95", "96", "98", "99", "G"), class = "factor"), V8 =
structure(c(38L,
5L, 36L, 1L, 36L, 30L), .Label = c("0", "1", "10", "11",
"12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "2", "20",
"21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "29", "3", "30",
"31", "32", "33", "34", "36", "4", "5", "55", "6", "7", "72",
"8", "9", "H"), class = "factor"), V9 = structure(c(120L,
60L, 52L, 111L, 49L, 17L), .Label = c("0", "1", "10", "100",
"101", "102", "103", "104", "105", "109", "11", "112", "114",
"115", "117", "119", "12", "121", "123", "124", "13", "130",
"14", "141", "15", "16", "163", "17", "175", "18", "187",
"19", "194", "2", "20", "21", "22", "23", "24", "243", "25",
"26", "27", "28", "29", "3", "30", "31", "32", "33", "34",
"35", "36", "37", "38", "39", "4", "40", "41", "42", "43",
"44", "45", "46", "47", "48", "49", "5", "50", "51", "52",
"53", "54", "55", "56", "57", "58", "59", "6", "60", "61",
"62", "63", "64", "65", "66", "67", "68", "69", "7", "70",
"71", "72", "73", "74", "75", "76", "77", "78", "79", "8",
"80", "81", "82", "83", "84", "85", "87", "88", "89", "9",
"90", "91", "92", "94", "95", "97", "98", "99", "I"), class = "factor"),
V10 = structure(c(109L, 36L, 32L, 3L, 46L, 9L), .Label = c("0",
"1", "10", "100", "101", "103", "105", "106", "11", "114",
"115", "119", "12", "13", "130", "131", "14", "149", "15",
"150", "16", "17", "18", "19", "199", "2", "20", "21", "22",
"23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "3", "30", "31",
"32", "33", "34", "35", "36", "37", "38", "39", "4", "40",
"41", "42", "43", "44", "45", "46", "47", "48", "49", "5",
"50", "51", "52", "53", "54", "55", "56", "57", "58", "59",
"6", "60", "61", "62", "63", "64", "65", "66", "67", "68",
"69", "7", "70", "71", "72", "73", "74", "75", "76", "77",
"78", "79", "8", "80", "81", "82", "83", "84", "85", "87",
"88", "89", "9", "90", "92", "94", "95", "96", "99", "K"), class =
"factor"),
V11 = structure(c(125L, 61L, 66L, 116L, 74L, 106L), .Label = c("0",
"1", "10", "100", "101", "103", "104", "105", "107", "109",
"11", "110", "111", "113", "114", "115", "116", "117", "119",
"12", "122", "123", "125", "13", "132", "133", "134", "135",
"138", "14", "148", "15", "155", "16", "17", "18", "19",
"2", "20", "200", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "263",
"27", "28", "29", "3", "30", "31", "32", "33", "34", "35",
"36", "37", "38", "39", "4", "40", "41", "42", "43", "44",
"45", "46", "47", "48", "49", "5", "50", "51", "52", "53",
"54", "55", "56", "57", "58", "59", "6", "60", "61", "62",
"63", "64", "65", "66", "67", "68", "69", "7", "70", "71",
"72", "73", "74", "75", "76", "77", "78", "79", "8", "80",
"81", "82", "83", "84", "85", "86", "87", "89", "9", "90",
"91", "93", "94", "95", "96", "98", "99", "L"), class = "factor"),
V12 = structure(c(47L, 42L, 43L, 1L, 42L, 1L), .Label = c("1",
"10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19",
"2", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28",
"29", "3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37",
"38", "39", "4", "40", "41", "42", "44", "45", "47", "5",
"6", "7", "73", "8", "9", "M"), class = "factor"), V13 = structure(c(81L,
36L, 26L, 30L, 26L, 19L), .Label = c("0", "1", "10", "107",
"11", "112", "12", "123", "13", "14", "15", "153", "16",
"161", "17", "179", "18", "19", "2", "20", "21", "22", "23",
"24", "25", "26", "27", "28", "29", "3", "30", "31", "32",
"33", "34", "35", "36", "37", "38", "39", "4", "40", "41",
"42", "43", "44", "45", "46", "47", "48", "49", "5", "50",
"51", "52", "53", "54", "55", "56", "57", "58", "59", "6",
"60", "62", "63", "64", "65", "66", "67", "68", "7", "73",
"74", "75", "77", "8", "82", "9", "93", "N"), class = "factor"),
V14 = structure(c(62L, 16L, 8L, 2L, 59L, 37L), .Label = c("0",
"1", "10", "104", "109", "11", "12", "13", "14", "15", "16",
"17", "18", "19", "2", "20", "21", "22", "23", "24", "25",
"26", "27", "28", "29", "3", "30", "31", "32", "33", "34",
"35", "36", "37", "38", "39", "4", "40", "41", "42", "43",
"44", "45", "46", "47", "48", "5", "50", "53", "54", "55",
"57", "6", "61", "67", "7", "71", "72", "8", "9", "97", "P"
), class = "factor"), V15 = structure(c(68L, 7L, 67L, 25L,
16L, 14L), .Label = c("0", "1", "10", "11", "111", "12",
"13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "2", "20", "21",
"22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "3", "30",
"31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38", "39", "4",
"40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47", "48", "49",
"5", "50", "52", "53", "54", "56", "59", "6", "60", "61",
"63", "64", "65", "66", "69", "7", "72", "8", "84", "86",
"9", "Q"), class = "factor"), V16 = structure(c(68L, 21L,
7L, 15L, 14L, 37L), .Label = c("0", "1", "10", "11", "12",
"13", "14", "142", "15", "150", "16", "17", "18", "19", "2",
"20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29",
"3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38",
"39", "4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47",
"48", "49", "5", "50", "51", "52", "54", "55", "56", "57",
"6", "60", "61", "63", "65", "66", "68", "7", "72", "75",
"8", "9", "R"), class = "factor"), V17 = structure(c(91L,
38L, 24L, 2L, 10L, 88L), .Label = c("0", "1", "10", "104",
"106", "11", "110", "117", "118", "12", "129", "13", "14",
"15", "16", "163", "17", "170", "171", "18", "19", "2", "20",
"21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "3",
"30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38", "39",
"4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47", "48",
"49", "5", "50", "51", "52", "53", "54", "55", "56", "57",
"58", "59", "6", "60", "61", "62", "64", "65", "66", "67",
"68", "69", "7", "72", "73", "74", "75", "76", "77", "78",
"79", "8", "80", "82", "9", "91", "95", "S"), class = "factor"),
V18 = structure(c(84L, 28L, 21L, 1L, 5L, 43L), .Label = c("0",
"1", "10", "11", "12", "120", "121", "13", "134", "137",
"14", "146", "15", "157", "16", "166", "17", "18", "19",
"2", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28",
"29", "291", "3", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36",
"37", "38", "39", "4", "40", "41", "42", "43", "44", "45",
"46", "47", "48", "49", "5", "50", "51", "52", "53", "54",
"55", "56", "57", "58", "59", "6", "60", "61", "62", "64",
"65", "66", "67", "68", "69", "7", "70", "77", "78", "79",
"8", "83", "9", "98", "T"), class = "factor"), V19 = structure(c(101L,
36L, 34L, 85L, 31L, 44L), .Label = c("0", "1", "10", "100",
"101", "104", "11", "110", "115", "12", "13", "14", "15",
"157", "16", "162", "17", "170", "18", "19", "2", "20", "206",
"21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "3",
"30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38", "39",
"4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47", "48",
"49", "5", "50", "51", "52", "53", "54", "55", "56", "57",
"58", "59", "6", "60", "61", "62", "63", "64", "65", "66",
"67", "68", "69", "7", "70", "71", "73", "74", "75", "76",
"79", "8", "80", "81", "82", "84", "86", "87", "88", "89",
"9", "90", "92", "93", "95", "98", "99", "V"), class = "factor"),
V20 = structure(c(26L, 18L, 1L, 1L, 2L, 1L), .Label = c("0",
"1", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "19",
"2", "21", "23", "24", "25", "26", "3", "4", "49", "5", "6",
"7", "8", "9", "W"), class = "factor"), V21 = structure(c(66L,
5L, 62L, 2L, 9L, 14L), .Label = c("0", "1", "10", "11", "12",
"13", "138", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "2", "20",
"21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "3",
"30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38", "39",
"4", "40", "41", "42", "43", "44", "45", "46", "47", "48",
"49", "5", "50", "51", "52", "53", "54", "55", "6", "60",
"63", "65", "68", "7", "70", "76", "8", "89", "9", "90",
"Y"), class = "factor")), .Names = c("V1", "V2", "V3", "V4",
"V5", "V6", "V7", "V8", "V9", "V10", "V11", "V12", "V13", "V14",
"V15", "V16", "V17", "V18", "V19", "V20", "V21"), row.names = c(NA,
6L), class = "data.frame")
On Tue, Mar 19, 2013 at 12:16 PM, Berend Hasselman <[email protected]> wrote:
>
> On 19-03-2013, at 13:06, Sahana Srinivasan <[email protected]>
> wrote:
>
> > I.. did?
> > Here is the whole thing:
> >
> > Output dataframe, df2: (NA is because I haven't filled those cells in
> yet,
> > but they will have numeric values)
> >
> 1462696298812268108381201091254781626868918410126662NANANANANANANANANANANANA
> > NANANANANANANANANA
> >
> > Input dataframe, df1:
> >
> 1GENEACDEFGHIKLMNPQRSTVWY2amt:Amet_00012902334171612422939635201325342732312
>
> Not good enough.
>
> Use dput(head(df1)) and dput(head(df2))
> And paste the result in the message.
>
> Berend.
[[alternative HTML version deleted]]
______________________________________________
[email protected] mailing list
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html
and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
